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2025年1月
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發(fā)布時(shí)間: 2022-08-03
困擾科學(xué)家近50年的蛋白質(zhì)折疊難題
蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎(chǔ),，是組成人體一切細(xì)胞、組織的重要成分,。無論是肌肉收縮,、眼睛感光，還是消化食物等,，人類的生命活動(dòng)無時(shí)無刻都需要蛋白質(zhì)的參與,。
而蛋白質(zhì)之所以功能豐富，很大程度得益于其獨(dú)特的空間結(jié)構(gòu),?？梢哉f,，想要更了解人本身,，就需要破譯每個(gè)蛋白質(zhì)的復(fù)雜結(jié)構(gòu)。然而,，蛋白質(zhì)中的長(zhǎng)鏈氨基酸扭曲,、折疊并交織成復(fù)雜的三維結(jié)構(gòu)，為結(jié)構(gòu)破譯設(shè)下層層關(guān)卡,，這才有困擾了科學(xué)家近50年的“蛋白質(zhì)折疊難題”,。
AI賦能蛋白質(zhì)計(jì)算
隨著科技革命和產(chǎn)業(yè)轉(zhuǎn)型浪潮的推進(jìn)，人工智能賦能科學(xué)研究的趨勢(shì)勢(shì)不可擋,，蛋白質(zhì)科學(xué)首當(dāng)其沖,。借助AI顛覆蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，使分子生物學(xué)家從基于蛋白質(zhì)氨基酸序列研究轉(zhuǎn)變?yōu)橛妙A(yù)測(cè)的結(jié)構(gòu)分析蛋白質(zhì)功能,，影響了整個(gè)生物科學(xué)的研究范式,。
最典型的就是人盡皆知的AlphaFold。DeepMind 宣布,，人們首次發(fā)現(xiàn)了一種通過計(jì)算來預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的方法,。即使在不知道相似結(jié)構(gòu)的情況下,，AI 也可以在原子層面上精確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)，使得不可能變?yōu)榭赡堋?/span>
DeepMind表示,，AlphaFold 可以周期性地以原子精度預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),，利用多序列對(duì)齊和深度學(xué)習(xí)算法設(shè)計(jì)，結(jié)合關(guān)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的物理和生物學(xué)知識(shí)提升預(yù)測(cè)效果,。其突破性的研究成果廣泛應(yīng)用在生命學(xué)科各分支,，是對(duì)結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)顛覆性突破。
AI模型+曙光算力服務(wù),，蛋白質(zhì)功能預(yù)測(cè)與設(shè)計(jì)未來可期
擴(kuò)展來看,，不只是對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)的變革，AI 對(duì)整個(gè)科研領(lǐng)域還有大量的潛力等待挖掘,，如 AI + 數(shù)學(xué),、AI + 化學(xué)、AI + 醫(yī)藥等,，這些應(yīng)用將幫助科研人員探索引發(fā)某些疾病的機(jī)制,，并為設(shè)計(jì)藥物、農(nóng)作物增產(chǎn)研發(fā)鋪平道路,。
曙光智算作為智能計(jì)算時(shí)代的算力服務(wù)商,，在“AI+Science”等領(lǐng)域持續(xù)深耕，已沉淀大量前沿實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),，實(shí)現(xiàn)了對(duì)開發(fā)環(huán)境的快速部署,。針對(duì)開發(fā)流程，對(duì)運(yùn)算資源按照訓(xùn)練任務(wù)進(jìn)行分割和分發(fā),，并額外支持容器鏡像管理,、權(quán)限管理、交互界面圖形化等功能,，以幫助用戶更快速地介入人工智能領(lǐng)域,，聚焦實(shí)際算法的優(yōu)化和迭代，促進(jìn)人工智能技術(shù)的快速落地,。
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