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攜手瑞金醫(yī)院,，曙光助力“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”研究


1. 項(xiàng)目需求

“科研發(fā)現(xiàn)不應(yīng)停留在實(shí)驗(yàn)室，而是要轉(zhuǎn)化為臨床可用的新檢查或治療手段”,，這是21 世紀(jì)初提出的最早關(guān)于“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”的概念,。

不破不立，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)打破了臨床與實(shí)驗(yàn)室之間的“屏障”,，是將基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究和臨床治療連接起來(lái)的一種新的思維方式,。在中國(guó)，轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)已成為國(guó)家在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域里一個(gè)重大焦點(diǎn),。

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2. 解決方案

中科曙光助力上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院（以下簡(jiǎn)稱“瑞金醫(yī)院”）搭建“臨床資源深度分析和挖掘測(cè)序模塊計(jì)算平臺(tái)”,，通過(guò)提升醫(yī)療數(shù)據(jù)檢索、統(tǒng)計(jì)分析,、圖形化呈現(xiàn)在內(nèi)的大規(guī)模數(shù)據(jù)挖掘能力,，推進(jìn)“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”領(lǐng)域研究。

曙光為瑞金醫(yī)院提供計(jì)算存儲(chǔ)網(wǎng)絡(luò),、管理網(wǎng)絡(luò),、GridView集群管理調(diào)度系統(tǒng)，并為用戶提供應(yīng)用開發(fā)環(huán)境以及在線運(yùn)維系統(tǒng)等覆蓋全生命周期的技術(shù)服務(wù),。系統(tǒng)主要應(yīng)用于基因測(cè)序相關(guān)的應(yīng)用,，而基因測(cè)序軟件如 SOAP2，BWA,，BWASW、VCAKE,、QSRA 等在計(jì)算時(shí)會(huì)產(chǎn)生中間數(shù)據(jù),，存儲(chǔ)性能的好壞直接影響整個(gè)計(jì)算過(guò)程所需要的時(shí)間，因此對(duì)存儲(chǔ)的性能要求非?？量?。

曙光ParaStor分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)可通過(guò)性能與容量的線性增長(zhǎng)，滿足存儲(chǔ)系統(tǒng)對(duì)數(shù)據(jù)處理能力和擴(kuò)展性的要求,，并通過(guò)多種技術(shù)手段,，從物理底層到邏輯層全方位保證存儲(chǔ)系統(tǒng)高可靠性和高可用性，滿足前端多種基因測(cè)序軟件,、多種業(yè)務(wù)應(yīng)用的存儲(chǔ)對(duì)接需求,。此外,，為了協(xié)助系統(tǒng)高效交付用戶并快速上線，以及保障上線后的售后服務(wù),，通過(guò)曙光 EasyOP 在線運(yùn)維平臺(tái),，用戶可隨時(shí)聯(lián)絡(luò)曙光擁有深入行業(yè)應(yīng)用經(jīng)驗(yàn)的相關(guān)各領(lǐng)域?qū)＜译S時(shí)對(duì)集群進(jìn)行線上優(yōu)化，并可通過(guò) EasyOP 在線運(yùn)維平臺(tái)預(yù)約上門調(diào)優(yōu)服務(wù),。

基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)正以每12-18個(gè)月10倍的速度快速增長(zhǎng),，生命科學(xué)領(lǐng)域?qū)τ?jì)算的需求及要求將更廣闊和嚴(yán)苛。未來(lái),，曙光將攜手更多生命科學(xué)領(lǐng)域客戶,，為其業(yè)務(wù)提供有效的性能保障和技術(shù)支持。

3. 客戶收益

“臨床資源深度分析和挖掘測(cè)序模塊計(jì)算平臺(tái)”,，通過(guò)提升醫(yī)療數(shù)據(jù)檢索,、統(tǒng)計(jì)分析、圖形化呈現(xiàn)在內(nèi)的大規(guī)模數(shù)據(jù)挖掘能力,，推進(jìn)“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”領(lǐng)域研究,。

由瑞金醫(yī)院承擔(dān)建設(shè)的國(guó)家轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心 (上海)，通過(guò)聚焦危害中國(guó)人群健康的疾病,，包括白血病在內(nèi)的血液系統(tǒng)惡性腫瘤及胃腸腫瘤,、糖尿病等代謝性疾病，以及冠心病,、高血壓等心腦血管疾病等,，讓寫在紙上的論文盡快變成用于臨床的新治療方法，聯(lián)手共克重大疾病,。


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